日本人主要祖源来自古华夏大陆
来源：外网译文
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遗传学表明，日本人种有两个来源，一是海洋来的岛人，一是中国及东亚大陆的 渡来人。
海岛人较早来到列岛，即绳纹人，为日本本土人种，自1万年前的石器时代的日本文化就是这些人创造的，他们以渔猎为生。
外貌特点：头较短，方圆型，下颚呈方圆型，肤色偏棕色，眉毛浓，眼睛大，鼻根矮，鼻锋宽大，上下两排牙齿并列平行，身材非常矮，但很壮实，出土的化石表明，男性身高在155左右，女性为145。
日本岛上居住的本土绳文人是与大陆渡来人不同的人种。关于绳文人的来源，日本研究者的猜想很多。有一点是公认的，现代北海道的虾夷人和种子岛的部分居民应该是绳文人的后代。根据虾夷人的遗传结构，我们能够了解绳文人的来源。很幸运，虾夷人的Y 染色体给出了明确的结论，他们大多是D，还有部分的C。他们必然是早期的棕色人种的后代。
在中国的商周时代以至更早，东亚大陆棕色人已经进入日本。日本列岛在当时可以通过大陆架很容易地到达。
而当黄色人种来到东北亚时，日本列岛与大陆已成为茫茫大洋相隔的海岛。日本成为华夏人传说中的蓬莱仙岛。
中国历史的春秋时代，东渡日本的大陆人被称为弥生人渡来系人种，主要是来自东亚大陆的移民，为中国和韩国移民。他们在公元前300年-公元300年期间来到日本，为日本带来新的铁器农业文明，并在以后漫长的日本文明史中发挥了重要的作用。
渡来人外貌特点：头颅骨为高颅，呈长型，脸型也为长型，肤色为淡黄色和偏深的黄色，眼睛中等大小，鼻根中等，鼻锋较窄较高，上排牙齿在下排牙齿外面，身材较高挑，出土化石男性平均身高164。
日本的黄种人——弥生人，是中国的春秋战国时期迁入的，进入口是九州岛岛。他们向本州岛及更东北方向扩张的过程中，对旧石器的绳文人进行了征服和奴役。势必造成了绳文人比例的下降。但是到1800年，我们可以看到本州岛岛的北部开始到库页岛，都还是虾夷人的领地。
从日本各地的遗传结构看，棕色人种的遗传比例虽然是从西往东递减，但各地的该种成分都不在少数。所以日本人总体上应该算是两个人种的混血区域。
对于虾夷人奇特体质，以前的人种学家猜想很多，最后有人认为这是一个处于黄种人和白种人之间的过渡种群。这实在是一种匪夷所思的观点，他们居然与远在地球另一面的白种人有关。其实他们的体质形态独特性说明，棕色人种经过漫长的历史发展，已然形成了几种不同的体质，至少澳洲土著、尼格利陀人和虾夷人是有区别的。
青藏高原的情况要复杂得多。藏族是一个很晚才形成的民族。他们是秦汉时期开始向高原迁徙的羌族中的两支——发羌和唐旄。在进入高原后，与当地的雅砻土著发生了混血。在藏族起源的神话传说中，雅砻土著被转化成了丑陋的猕猴，羌人则是仙女，两者婚配繁衍出了藏族。其实雅砻土著属于棕色人种，在羌人的审美观念中，他们的确是非常丑陋的。他们的混血使羌人很快适应了高原的环境。也使青藏高原的历史进入了一个全新的时期。我们在研究现在的藏族人的遗传结构时，还是能看到大量的D 型Y 染色体(注20)。而观察藏族的面貌特征，甚至在同一个村子中，也会看到两种截然不同的样式。有的人是挺拔的羌人的面容，有的人则是敦圆的棕色人种面貌，肤色的差异也很大。
当我们在青藏高原进一步扩大调查范围，研究氐羌的其它民族，更有趣的现象出现了。曾经在中国南北朝的历史舞台上叱咤风云的氐族，现在仅存于四川和甘肃边界地区，有着惊人的Y 染色体遗传结构——全部的D 型。难道他们也是棕色土著的后代?我们恍然大悟，原来在汉藏语中，“氐”这个词，从来就是“底层”的意思。羌人来到青藏高原，把原本就在这里的土著居民称为“氐族”，因为他们“原抵”就在那里。我们再看羌族的结构，他们也含有部分的D 型，但还是以O2 为主。再看华族，就几乎不含有D 型了。所以，“氐—羌—华”原初大概就是这么分化的。而历史上对西戎民族的认识，一开始就有氐和羌的不同概念。我们进一步计算当地的D 和O 的年代，发现D 至少在四万年以上，而O 却最多纔有一万年历史。青藏高原上的D 型成分与安达曼群岛棕色人种的D 型应该是有关系的。
在东南亚的中南半岛，这样的遗传成分也是存在的，并且在各个民族中的成分比例不同。东南亚是世界上民族结构最复杂的地区之一，南亚语系的百濮民族是最古老的黄种居民。由于生活于热带，他们的肤色很深，比如佤族就是我国肤色最深的一个民族。但是有些民族的肤色就深得过份了，比如泰国和马来西亚边境上的土著Senoi 族，再加上他们其它一些特别体征，不得不让人怀疑他们是否含有大量棕色成分。可惜他们的遗传结构至今还没有调查过。
对于远东地区的人种替代过程，目前的数据只能说到这么多。我们还不能肯定是否有更多的层次的存在。因为当一层一层的替代过程发生以后，我们能看到的往往只是挡在最前面的那最近的一层。当我们用更精细的工作去研究分析的时候，我们要对人群的遗传结构作抽丝剥茧的调查，或许通过蛛丝马迹，我们会发现更多的层次，来讲述更多的远东人类历史舞台上的传奇故事。这些传奇故事可能包括棕色人种之中D 型替代C 型，黄色人种之中O型替代P 型。
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